2005年3月，根据院党组的决定，北京分院正式组建
2005年4月10日，京区党委主办的《科苑先锋导读》改版为《中国科学院北京分院院刊》。
2005年5月7日，“科苑先锋”网站改版为北京分院网站并开始运行。
2005年7月5日，中科院与天津市政府签订了全面合作协议，拉开了中科院与天津全面合作的序幕。
2005年7月31日，北京分院代表团前往秦皇岛市考察并签署《中国科学院北京分院——秦皇岛市人民政府全面科技合作协议书》。
2005年8月12日,北京分院建立“关键人才配偶安置就业协调机制”，解决科技骨干后顾之忧。
2005年10月20日，根据院调整合作分工区域的通知，北京分院院地合作负责联系的工作区域调整
2005年11月16日，北京分院与河北省科技厅共同举办的“中国科学院―河北省技术合作项目洽谈会暨签约仪式”在河北省石家庄市举行。
2005年12月7日，北京分院与怀柔区签署科技合作协议。
2005年12月16日，完成北京分院标识设计工作，并编制形象识别系统手册。
